O estuário do Guadiana é dono de uma área de sapal muito relevante. Os sapais de Castro Marim, zona de nidificação de peixes e aves, são um importante berçário para os flamingos.
Por outro lado, o declínio da pesca de rio contada por quem noutros tempos vivia dessa atividade, é resultado das barragens construídas a montante que vieram alterar a realidade das espécies que habitam este estuário. João Pedro Encarnação, investigador da Universidade do Algarve fala-nos das espécies invasoras que surgiram e de como lidar com esta realidade.