A extinção das espécies de água doce ocorre a um ritmo quatro a seis vezes superior ao das espécies terrestres ou marinhas.
Em Portugal, os ecossistemas ribeirinhos, fluviais e lacustres encontram-se debilitados.
A perda de biodiversidade e o estado ecológico do meio aquático levantam dúvidas quanto ao cumprimento da Directiva-Quadro da Água, até 2015.