Por volta de 1549, cerca de 50 anos depois do descobrimento do Brasil, a coroa resolve, finalmente, ocupar a nova colónia.
Tomé de Sousa é nomeado governador geral e segue para terras brasileiras à cabeça de um grupo onde se incluíam 200 soldados, 30 colonos, 400 degredados e seis jesuítas que iriam evangelizar os índios.
Chefiava os jesuítas o Padre Manuel da Nóbrega que se tornaria o primeiro provincial da companhia de Jesus no Brasil. Este foi o inicio de uma grande missão que só terminaria cerca de 200 anos mais tarde, quando os jesuítas foram expulsos da colónia.